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생명과학의 역사를 쓰는 사람들 Research Highlights

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인터뷰 박하람
논문 Haram Park*, Yeonsoo Choi*, Hwajin Jung*, Seoyeong Kim*, Suho Lee, Hyemin Han, Hanseul Kweon, Suwon Kang, Woong Seob Sim, Frank Koopmans, Esther Yang, Hyun Kim, August B. Smit, Yong Chul Bae, Eunjoon Kim (2020) Splice-dependent trans-synaptic PTP-IL1RAPL1 interaction regulates synapse formation and non-REM sleep. EMBO J (2020) e104150 (* contributed equally)
한줄요약 시냅스 접착 단백질인 PTP의 전기생리학적, 행동학적 역할 규명
박하람2.jpg


1. 배경지식

시냅스는 다양한 단백질의 집합체입니다. 시냅스의 정상발달을 위해서는 단백질들이 적재적소에 발현하여 단백질간의 적절한 상호작용이 있어야합니다. 시냅스 형성 초기에 이와 같은 중요한 역할을 하는 단백질에는 시냅스 접착 단백질이 존재합니다. 전시냅스와 후시냅스의 접착 단백질간의 결합이 이루어지면, 그로 인한 다양한 생화학적인 반응을 통하여 시냅스를 구성하는 시냅스내 단백질들이 자신의 위치를 찾아 배열하게 됩니다. 시냅스 접착 단백질의 종류도 굉장히 다양할 뿐만 아니라, 단백질이 발현 위치 혹은 isoform 따라서 결합하는 단백질의 종류마저도 달라지므로, 아직 뇌의 최소단위인 시냅스를 이해하는데에도 여전히 많은 연구가 필요합니다.

연구에서는 전시냅스 접착 단백질로 알려진 PTPd 시냅스 발달에서 어떠한 역할을 하는지 PTPd 결손쥐를 이용하여 연구하였습니다. PTPd intracellular domain에는 인산제거효소 기능을 지니고 있고, extracellular domain 다른 단백질들과의 결합에 결정적 역할을 하는4에서 6개의 amino acid 구성된 짧은 mini-exon A (meA) meB 존재합니다. 짧은 sequence 존재 유무에 따라서PTPd 결합 단백질들간의 결합세기가 영향을 받습니다. 이에 관한 in vitro 연구는 오랜시간 축적되어 왔으나, 이와 같은 발견이 실제로 in vivo에서 얼마나 중요한 역할을 하는지는 아직 알려진 바가 없었습니다.

또한, PTPd 자폐증, 조현증, 강박장애, ADHD 그리고 restless leg syndrome 다양한 신경발달장애와 밀접한 관련이 있음이 여러 환자 유전연구에서 보고된바 있습니다. 이는 PTPd 발현하는 시냅스들이 존재하는 신경 회로가 위와 같은 신경발달장애에 중요한 영향을 미친다는 것을 있습니다. 특히 중에 눈에 띄었던 것은 많은 경우 신경발달장애 환자들이 비정상적인 수면 패턴을 동반하는 경우가 많다는 것이었습니다. 이와 같이 PTPd 신경발달장애의 연관성을 동물 모델을 통해 밝힌 연구는 없었습니다.


2. 질문

PTPd 발현하는 시냅스 내에서 PTPd 시냅스 발달 혹은 기능에 어떠한 역할을 하는지 밝히고 싶다는 포괄적인 질문으로 연구를 시작하였습니다.


3. 발견

연구에서 크게 가지 PTPd 관련한 중요한 발견을 하였습니다. 첫째는 in vitro에서만 확인되었던 PTPd 후시냅스 접착 단백질의 종류인 IL1RAPL1 결합에 대한 기능을 in vivo에서 밝혔습니다. 특히, meA IL1RAPL1 PTPd간의 결합에 필수조건으로 알려져 있었는데, 연구에서 결합이 실제로 in vivo에서 PTPd 통한 시냅스 기능에 직접적 영향을 준다는 사실을 밝혔습니다. meA 발현하는 PTPd isoform 결손시켰을때, PTPd 전체 결손 시냅스와 마찬가지로 시냅스내 신호전달이 감소된 것을 발견하였습니다.

이같은 발견은 PTPd 시냅스 기능에 미치는 연쇄 작용의 일부를 보여주는 발견으로 이어졌습니다. PTPd IL1RAPL1 결합하므로서, IL1RAPL1 시냅스 변두리가 아닌 중심에 위치하도록 한다는 것을 보여주었습니다. PTPd 결손될 경우 IL1RAPL1 올바른 위치에 발현할 없게 되고, 이는 IL1RAPL1 인산화 정도를 감소하는 결과를 초래하였습니다. 연구에서 발견한 인산화 site 어떠한 생화학적 기작과 관여하는지는 밝히지 못하였으나, PTPd와의 IL1RAPL1 결합이 IL1RAPL1 후시냅스 발달 기작 안에 위치하게 하므로서 시냅스 발달에 중요한 역할을 한다는 것을 밝혔습니다.

마지막으로, PTPd IL1RAPL1 결합이 존재하는 시냅스가, 많은 신경발달장애에 동반되는 수면장애와 상관관계를 가지고 있다는 것을 밝혔습니다. PTPd 흥분성 신경세포에서 결손시켰을때, 수면시간이 감소한 것을 관찰하였습니다. 나아가 meA 포함한 PTPd isoform 전체 결손했을때도 마찬가지로 수면시간이 감소한 것을 관찰하였습니다. 특히 non-REM 시간이 감소하였습니다. 연구에서 직접적 인과관계까지는 밝히지 못하였으나, PTPd 발현하는 시냅스가 non-REM 수면을 유지 혹은 시작하는데에 기여한다는 것을 밝혔습니다.

 

4. 후속

논문에서 집중 조명한 meA 달리 meB또한 PTPd 다른 후시냅스 접착 단백질간의 결합에 많은 영향을 미치는 것이 in vitro에서 활발히 연구되어왔습니다. meB 포함한 isoform 발현하는 시냅스들은 meA 마찬가지로 sleep 관련 circuit 기여할 것인지, 아니면 별개의 시냅스 발달에 기여할 것인지에 대한 in vivo 연구는 전무한 상황입니다. PTPd isoform 따라 시냅스 발달에 기여하는 기작을 규명하는 일이 흥미로운 후속 연구의 방향성이 것이라 생각합니다.


5. 소감

연구와 함께 저도 성장하는 시간이었습니다. 단백질 하나의 역할을 밝히는데에도 이렇게 많은 노력이 필요한 것을 보면 ( 밝히려면 아직 많은 길이 남았음에도 불구하고) 생명의 신비는 끝이 없는 같습니다.


6. 기타

연구에 함께한 저희 팀원분들께 진심으로 감사드립니다. 또한 논문에 참여해주신 저자분들 모두 연구를 완성하는데 필요한 도움을 주셨습니다. 진심으로 감사드립니다. 마지막으로 7년간 지도해주신 지도 교수님이신 김은준 교수님! 감사드리고, 존경합니다.


  1. 정창욱, 하승민 (시냅스뇌질환 연구실, 김은준 교수님)

     <생후 7~21일 동안 memantine을 투여한 경우 Shank2 결손 생쥐의 사회성이 개선된다.> 1. 배경지식 자폐증은 어린 나이에 발병되는 신경발달장애 중 하나로 전 세계적으로 약 1%의 유병률을 보이며 최근 점점 환자 수가 증가하고 있습니다. 그러나 현재까지...
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  2. 장성민 (에피제네틱스 구조생물학 연구실, 송지준 교수님)

    < Cryo Electrom Microscopy (Cryo-EM) 으로 규명한 DOT1L – 유비퀴틴 뉴클레오좀 복합체 구조 > < 정상적인 뉴클레오좀 (파란색, 녹색)과 비교했을 때, DNA가 풀려 사라지고 히스톤 2차 구조가 손실되는 불안정화 현상이 관찰됨 (빨강) > 1. 배경지식 Histon...
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  3. 신왕용 (시냅스뇌질환 연구실, 김은준 교수님)

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  4. 김기정 (에피제네틱스 구조생물학 연구실, 송지준 교수님)

    <알데히드-알코올 탈수소효소의 구조 및 기능적 연구 > 1. 배경지식 박테리아에 널리 보존되어 있는 알데히드-알코올 탈수소효소(AdhE)는 발효과정에 관련된 효소이다. 알데히드-알코올 탈수소효소는 두 개의 도메인, 알데히드 탈수소효소와 알코올 탈수소효...
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  5. 유다슬이 (바이오이미징 & 광유전학 연구실, 허원도 교수님)

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  6. 서예지 (바이오이미징&광유전학 연구실, 허원도 교수님)

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  7. 김성수(바이오이미징&광유전학 연구실, 허원도 교수님)

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  8. 김경덕 (시냅스 뇌질환 연구실, 김은준 교수님)

     <전시냅스 단백질PTPσ에 의한 NMDA 수용체 안정성 조절 > 1. 배경지식 시냅스는 3,000 개 이상 종류의 단백질이 적절한 위치에 적절한 양 만큼 위치해야 제대로 기능할 수 있는 대단히 복잡한 구조체입니다. 시냅스가 형성되기 위해서는 두 뉴런의 신경 ...
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  9. 송유향, 황양선 (감각처리연구실, 이승희 교수님)

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  12. 이진형, 김보람, 김병수, 황가영, 이유진 (신경내부인지 연구실, 서성배 교수님)

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  13. 오양균 (NYU) (신경내부인지 연구실, 서성배 교수님)

    배경지식 동물들은 미각 이외에도 체내에 영양분을 인지할 수 있는 신경세포들을 가지고 있습니다. 이러한 영양분 인지 신경세포들은 대략 60 년 전에 전기생리학자들에 의해서 처음으로 발견되었습니다. 꽤 오래전에 발견 되었음에도 이들 신경세포들의 생물...
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  14. 김진은 (신경내부인지 연구실, 서성배 교수님)

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  15. 이준혁(신경교세포 연구실, 정원석 교수님)

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  16. 김재현(감각처리 연구실, 이승희 교수님)

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  17. 이승준_(분자신경생물학 연구소, 김은준 교수님 )

    1. 배경지식 자폐증(자폐 스펙트럼 장애, Autism spectrum disorders)은 뇌 발달장애의 한 종류로서, 세계 인구의 약 2%가 앓고 있습니다. 사회성 및 인지능력 저하가 주요 증상으로 꼽히지만 정확한 메커니즘은 알려지지 않았습니다. 이전에 저희 연구실에서...
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  18. 조혜림 (크로마틴 생물학 연구실, 이대엽 교수님)

    배경 지식 유전체는 단계적인 과정을 거쳐 특이적인 3차원 구조로 응축되어 있습니다. 최근 유전체가 지닌 3차원 구조의 기능적인 특징에 관한 연구 내용이 밝혀짐에 따라, 유전체의 3차원 구조가 어떻게 조절되고 조직화 되는지에 관한 연구가 활발히 이루어...
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    배경 지식 RNA 전사에 관련된 연구는 그동안 RNA polymerase가 주로 이동하는 방향이자 protein-coding 유전자 발현에 해당하는 sense 전사에 집중되어 있었습니다. 하지만 시퀀싱 기술의 발달로, 게놈의 상당 부분에서 반대 방향의 전사, 즉 antisense 전사...
    Date2022.05.02 By생명과학과 Views2043
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    질문 한정된 공간인 세포핵 안에서 분해되지 않는 단백질을 세포는 어떻게 처리할까? 발견 세포핵에서 잘 분해되지 않는 전사인자 단백질인 OTX2가 세포핵 돌출 소막에 쌓여 세포질의 리소좀(lysosome)으로 이동하는 새로운 세포 내 단백질 이동 경로를 규명...
    Date2024.02.22 By생명과학과 Views27
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