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생명과학의 역사를 쓰는 사람들 Research Highlights

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인터뷰 서호규
논문 Hogyu David Seo, Yoonjung Choi, Minhoo Kim, Keunsoo Kang, Takeshi Urano and Daeyoup Lee* (2017) The 19S proteasome is directly involved in the regulation of heterochromatin spreading in fission yeast. J. Biol. Chem. 2017 292: 17144
한줄요약 Proteasome의 새로운 비분해 기능발견 I
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인터뷰


 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요.

Proteasome은 이름에서도 알 수 있듯이 수십 개의 단백질들로 구성되어 있는 복합체로서 세포 내 단백질들을 분해하는 기능으로 잘 알려져 있습니다. 체내 전체 단백질의 1%를 혼자 담당할 정도로 매우 많은 proteasome이 세포 곳곳에서 활동하고 있으며 사람들은 이 활동들이 모두 단백질 분해에 작용한다고 알고 있었습니다.


하지만 proteasome이 단백질 분해에만 관여하는 것이 아니라 transcription protein chaperone으로 작용한다는 사실이 간간히 보고되고 있었습니다. 저는 이 점에 착안해 proteasome의 또 다른 역할을 규명하고자 하였으며, fission yeast model organism으로 연구를 진행했습니다. 결과적으로 저는proteasome centromere heterochromatin spreading을 막는 ‘수호자’ 역할을 한다는 것을 발견했습니다.


 

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2. 연구과정에서 있었던 에피소드를 소개해 주세요.

제가 통합과정 5년차 때 핵심 mutant가 갑자기 유전체에서 ‘사라지는’ 현상을 겪었습니다. 결론적으로revertant mutation이 생기는 것이었는데 초반에는 운이 나빴나보다 내지 내가 실수를 한 것이 있구나 하고 다시 mutant을 만들어 실험을 했는데 만드는 족족 mutant WT으로 돌아가는 진기한 경험을 했습니다. ‘자꾸 이러면 안되는데..’ 하는 불안한 마음이 들긴 했지만 이유를 알 수가 없어 계속 새로 mutant 를 만들어도 보고, 변형 mutant도 만들어보는 정말 여러가지 시도를 했지만 끝네 이 mutant를 쓸 수 없다는 결론을 내렸고, 5년차가 끝나가는 겨울에 프로젝트 방향을 완전히 수정해야 하는 큰 고비를 경험한 적이 있습니다.



3. 연구를 통해 얻은 지혜를 후배들에게 들려주세요.

위에 언급한 사건이 사실 연구를 하며 일어난 가장 큰 사건입니다. 5년간 일했던 것이 수포로 돌아가는 것 같은 경험은 다시 겪고 싶지 않을 정도로 끔찍한 경험이었습니다. 하지만 과학자라면, 내 앞의 문제 앞에 절망하기보다는 ‘이 문제를 어떻게 해결할 것인가?’ 에 초점을 맞춰야 한다는 사실을 깨닫는 계기이기도 했습니다. 물론 당장은 멘탈이 나가고 바로 학위과정을 그만두라는 감정의 지배를 받지만 그럴 때에는 잠시 실험을 내려놓고 좋아하는 사람들과 시간을 보내고 오면 다시 이성적으로 생각하고 있는 자신을 발견할 수 있을 것 입니다.


 


4. 나는 왜 생명과학자가 되었는가?


저는 ‘사람을 살리고 싶다’ 라는 분명한 목적이 있었습니다. 그래서 의사를 하려고 했지만 ‘로렌조 오일’ 이라는 영화를 보고 더 많은 사람을 살리기 위해서는 연구를 하는 것이 더 의미가 있다는 생각에 생명과학자가 되는 것으로 진로를 바꿨습니다. 얼핏 보기에는 순진한 꿈 같지만 이러한 큰 목표는 제가 이 연구에 대해 회의를 느낄 때마다 마음을 다시 다잡는 역할을 했습니다.


 


 


5. 다른 하고 싶은 이야기

    어리버리한 저를 인내하며 지도해주신 교수님, 감사합니다. 지금은 다들 전세계로 흩어져있는 연구실 형, 누나들 보고싶고 또 고맙습니다. 힘든 학위 과정을 함께 해 나가며 서로 의지가 되었던 후배들에게도 감사를 표합니다. 논문에 마침표를 찍는 순간 힘들었던 만큼 보람도 큰 것 같습니다. 이 맛에 연구를 하는 건지도 모르겠네요.



  1. 인선아 (진핵세포전사 연구실, 김재훈 교수님)

     <RNF20/40에 의한 열충격유전자 발현 조절 메커니즘> 1. 배경지식 진핵생물에서 DNA는 히스톤 단백질과 함께 ‘뉴클레오좀’이라는 단위로 존재합니다. 히스톤에는 Methylation, Acetylation, Phosphorylation, Ubiquitylation 등의 다양한 번역 후 수정(Post-...
    Date2019.02.07 By생명과학과 Views2733
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  2. 김성수(바이오이미징&광유전학 연구실, 허원도 교수님)

    그림1. monSTIM1의 활성화 개념 그림설명(좌), 빛 세기에 대한 세포 내 칼슘 활성도(우) 그림2. 비침습적 광조사를 받고 있는 쥐 (좌), 빛 자극에 따른 칼슘 신호 마커, c-Fos발현 (우) <빛의 민감도를 증가시킨 monSTIM1의 활성화를 통한 비침습적 뇌세포 칼...
    Date2020.02.03 By생명과학과 Views2733
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  3. 정지혜(시스템 및 합성생물학 연구실, 조병관 교수님)

    ▷인터뷰 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요. 단감의 경우 실제로 수확 후, 2주 후부터 연화가(물러짐) 진행되어 1달이 지나면 대부분의 단감이 연화되어 먹을 수 없습니다. 이렇듯 단감이 상품성을 가질 수 있는 기간은 한정적 임에도 불구하고, 단감을 재...
    Date2018.01.08 By생명과학과 Views2949
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  4. 조혜연 & 김무준 (신경회로망 연구실, 한진희 교수)

    <공포 기억 회상 시에 기억과 관련 없는 세포가 단 1%라도 활성화 되면 기억 회상 능력이 떨어진다.> 1. 배경지식 해마의 치사회는 공간에 대한 기억을 저장하는 뇌 영역이다. 치매 환자들이 치상회에 비정상적으로 높은 활동을 보인다. 옵신 단백질을 신...
    Date2018.07.17 By생명과학과 Views3043
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  5. 조혜림 (크로마틴 생물학 연구실, 이대엽 교수님)

    배경 지식 유전체는 단계적인 과정을 거쳐 특이적인 3차원 구조로 응축되어 있습니다. 최근 유전체가 지닌 3차원 구조의 기능적인 특징에 관한 연구 내용이 밝혀짐에 따라, 유전체의 3차원 구조가 어떻게 조절되고 조직화 되는지에 관한 연구가 활발히 이루어...
    Date2021.12.29 By생명과학과 Views3080
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  6. 송요셉(시스템 및 합성 생물학 연구실, 조병관 교수님)

    ▷인터뷰 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요. 화석연료는 에너지 연료로만 사용되는 것이 아니고, 정유시 발생하는 석유화학제품도 제약, 섬유 산업 등 다양한 분야에서 활용되고 있습니다. 화석연료 고갈 문제 및 사용시 발생하는 환경문제를 해결하기 ...
    Date2018.02.05 By생명과학과 Views3114
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  7. 서호규(크로마틴 연구실, 이대엽 교수님)

    ▷인터뷰 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요 이 논문은 제 직전 논문의 후속 연구논문입니다. 이전 논문에서 Proteasome이 fission yeast centromere에서 heterochromatin spreading을 막는 새로운 기능이 있다는 것을 밝혔고, 이번 논문에서는 이러한 prot...
    Date2018.03.13 By생명과학과 Views3118
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  8. 변현종(카이스트 부설 한국과학영재학교 미생물공학실, 안정훈 교수님) - 카이스트 생명과학과 학부생

     ▷인터뷰 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요. 타입 I 분비 시스템(T1SS) 중 “폴리펩타이드를 수송하는 ABC 수송체”들의 단백질 분비 특성에 관해 연구한 논문입니다. 우리는 Pseudomonas fluorescens 박테리아가 보유한 ABC 수송체인 “TliDEF계”를 모델 시...
    Date2018.02.05 By생명과학과 Views3212
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  9. 정영석 (시스템신경과학 연구실, 정민환 교수님)

    1. 배경지식 해마는 우리 뇌의 대뇌 피질 안쪽, 내측 측두엽에 위치하는 뇌 구조로 새로운 사실을 학습하고 기억하는 데에 중요한 뇌로 알려져 있습니다. 해마가 손상이 되면 새로운 정보를 기억하지 못하게 되는 데, 실제로 치매환자들의 해마가 정상인에 비...
    Date2018.07.04 By생명과학과 Views3216
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  10. 정창욱, 하승민 (시냅스뇌질환 연구실, 김은준 교수님)

     <생후 7~21일 동안 memantine을 투여한 경우 Shank2 결손 생쥐의 사회성이 개선된다.> 1. 배경지식 자폐증은 어린 나이에 발병되는 신경발달장애 중 하나로 전 세계적으로 약 1%의 유병률을 보이며 최근 점점 환자 수가 증가하고 있습니다. 그러나 현재까지...
    Date2019.04.03 By생명과학과 Views3267
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  11. 이윤정 (에피제네틱스 구조생물학 연구실, 송지준 교수님)

     <그림. MRG15 binding to ASH1L releases the autoinhibitory loop, and activates ASH1L histone methyltransferase activity> 1. 배경지식 DNA는 히스톤 H2A, H2B, H3, H4가 각각 한 쌍씩 8개로 결합해 이루어진 octamer에 감겨, 크로마틴의 가장 기본 단...
    Date2019.03.28 By생명과학과 Views3274
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  12. 전종철 (진핵세포전사 연구실, 김재훈 교수님)

    <효모 Set1 complex 의 H2B ubiquitylation 의존적 H3K4 methylation 기작> 1. 배경지식 핵산인 DNA와 단백질인 히스톤은 염색체의 기본 구성인자인 nucleosome을 이룹니다. DNA를 기반으로 하는 다양한 생명현상들 예컨데 DNA replication, DNA repair, DNA ...
    Date2018.10.24 By생명과학과 Views3327
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  13. 박하람 (시냅스뇌질환 연구실, 김은준 교수님)

    1. 배경지식 시냅스는 다양한 단백질의 집합체입니다. 시냅스의 정상발달을 위해서는 단백질들이 적재적소에 발현하여 단백질간의 적절한 상호작용이 있어야합니다. 시냅스 형성 초기에 이와 같은 중요한 역할을 하는 단백질에는 시냅스 접착 단백질이 존재합...
    Date2020.04.30 By생명과학과 Views3332
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  14. 서호규(크로마틴 연구실, 이대엽 교수님)

    ▷인터뷰 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요. Proteasome은 이름에서도 알 수 있듯이 수십 개의 단백질들로 구성되어 있는 복합체로서 세포 내 단백질들을 분해하는 기능으로 잘 알려져 있습니다. 체내 전체 단백질의 1%를 혼자 담당할 정도로 매우 많은 pr...
    Date2018.03.13 By생명과학과 Views3397
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  15. 최원영(분자종양유전학 연구실, 임대식 교수님)

    ▷인터뷰 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요. Hippo pathway의 effector protein인 YAP과 TAZ의 활성이 직접적으로 위암을 일으킬 수 있다는 것을 동물(마우스)모델로 증명하고, 분자적으로는 YAP activation이 MYC을 upregulation 하는 기전을 통해 암이 발...
    Date2018.04.30 By생명과학과 Views3466
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  16. 최지헌 (신경발생학 연구실, 김진우 교수님)

    <그림. 망막 전구세포에서의 mTORC1 과활성이 세포주기 진행 및 신경세포 발생을 촉진하다.> 1. 배경지식 척추동물의 신경계는 발생과정에서 신경전구세포 (neural progenitor cell)가 분열(proliferation)을 반복하며 점차 신경세포와 교세포로 분화(differe...
    Date2018.07.10 By생명과학과 Views3474
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  17. 신혜림 (세포신호전달 연구실, David Helfman 교수)

    ▷인터뷰 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요. 암세포의 전이 및 산포는 세포 이동 및 세포 간 응집을 포함한 과정으로부터 비롯된 결과입니다. 이러한 과정은 세포 형태의 변화를 수반하며, 액틴 또는 이와 결합하는 다양한 단백질의 변이가 전이과정에서 ...
    Date2017.09.04 By관리자 Views3528
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  18. 김나연(바이오이미징/광유전학 실험실, 허원도 교수님)

    ▷인터뷰 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요. Protein oligomerization is an important molecular mechanism in many biological processes that control numerous cellular events. We investigated the property of cryptochrome2 (CRY2) from Arabidops...
    Date2017.11.13 By생명과학과 Views3536
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  19. 정현진 (바이오이미징 및 광유전학 실험실, 허원도 교수님)

    <광활성 Flp을 개발, 마우스 머리에 LED를 비추어 유전자 발현을 조절함> 1. 배경지식 유전자 기능 연구를 수행하는데 있어 가장 일반적인 방법인 유전자 변형 실험모델을 만드는 것은 많은 시간, 비용, 노력 등이 소요됩니다. 연구를 수행하는데 있어 필요한...
    Date2019.01.24 By생명과학과 Views3592
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  20. 김정진(행동 유전학 실험실, 김대수 교수)

     ▷인터뷰 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요. 우리 뇌 안에는 무수한 억제성 회로가 있지만, 그들의 정보 전달 방식에 대해서는 잘 밝혀져 있지 않습니다. 본 연구팀은 기저핵에서 나오는 억제성 신호들이 어떠한 방식으로 다양한 운동 신호를 처리하는가 ...
    Date2017.10.12 By생명과학과 Views3669
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