KAIST 생명과학과동창회
  • News & Events
  • 생명과학의 역사를 쓰는 사람들 Research Highlights

생명과학의 역사를 쓰는 사람들 Research Highlights

Extra Form
인터뷰 이진형
논문 Seung Yeon Lim, Hyejin You, Jinhyeong Lee, Jaejin Lee, Yoojin Lee, Kyung-Ah Lee, Boram Kim, Ji-Hoon Lee, JiHyeon Jeong, Sooin Jang, Byoungsoo Kim, Hyungjun Choi, Gayoung Hwang, Min Sung Choi, Sung-Eun Yoon, Jae Young Kwon, Won-Jae Lee, Young-Joon Kim, Greg S.B. Suh. Identification and characterization of GAL4 drivers that mark distinct cell types and regions in the Drosophila adult gut. Journal of Neurogenetics, 1-11.
한줄요약 초파리 장에서의 라인 별 발현 패턴 라이브러리 구축

 


1.   배경지식

초파리에서 GAL4-UAS system은 특정 부위에 특정 유전자를 발현시킬 수 있게 해 줍니다. GAL4는 yeast transcription activator protein이고 UAS는 GAL4가 특정적으로 붙는 enhancer인데 GAL4가 있으면 UAS를 enhancer로 가지는 유전자의 전사가 일어나게 됩니다. Brain의 경우 다양한 초파리 Gal4 line들에서 어떻게 발현되는지 조사한 database가 만들어져 있습니다. 하지만 gut의 경우에는 이러한 library가 없어 어떤 cell type이나 region을 특정할 때 어떤 Gal4 line을 써야 할지 알기 힘든 상황입니다.

초파리의 장은 장의 여러 기능들을 연구하기 위한 좋은 모델 중 하나입니다. 초파리의 장에서는 gut-brain axis를 바탕으로 소화, 흡수, 배설을 비롯한 식이 변화에 따른 장에서의 반응, 장내 미생물 변화와 면역 등이 활발하게 연구되고 있습니다. 이렇듯 gut의 역할도 다양하고 많은 연구가 진행되고 있지만 brain과 달리 Gal4 line의 발현 패턴을 정리해둔 것이 없습니다. 저희는 gut에서의 Gal4 line 발현 패턴을 정리해서 library 형태로 만들어 두어 앞으로 누구든지 gut에서 실험하는데 있어 원하는 cell type이나 region을 특정하여 실험하는데 도움이 되게 했습니다.

2.   질문

여러 초파리 Gal4 line들의 gut에서 발현 패턴을 확인하여 그것을 library로 만들어 초파리의 장을 연구하는 모든 사람들에게 도움이 되고자 하였습니다. 

3.   발견

Bloomington Drosophila Stock Center(BDSC)의 Janelia fly line들 중 초파리 장에서 발현되는 유전자들과 관계된 Gal4 line들을 선정하였습니다. 저희 랩을 비롯한 서울대, 성균관대, GIST의 네 랩에서 585개의 Gal4 line들에서 gut의 발현 패턴을 확인하였고, 그 중 발현이 있는 353개의 Gal4 line들은 발현이 있는 부분의 확대한 이미지를 얻었습니다. 이 라인들을 cell type별로 몇 라인 씩이나 나왔는지 통계를 내었고 region별로 어디에서 발현이 나왔는지 정리했습니다. 그리고 그 데이터를 Korea Drosophila Resource Center(KDRC, kdrc.kr)의 K-Gut Project에 업로드하여 전세계의 사람들이 모두 볼 수 있도록 하였습니다.

4.   후속

현재 이 연구에 참여한 네 랩에서 각각의 후속 연구를 진행 중이며 저희 랩 같은 경우는 gut 발현 패턴 database를 바탕으로 gut에서 nutrient sensing cell이나 유전자들을 찾고 규명하는 작업을 진행하고 있습니다.

5.   소감

대학원에 들어오고 얼마 되지 않아 시작하기도 했고 서로 다른 연구를 하는 네 랩, 저희 랩을 포함한 서울대 이원재 교수님 랩, 성균관대 권재영 교수님 랩, GIST 김영준 교수님 랩이 다 같이 하는 큰 프로젝트였기에 처음에는 설레기도 하고 긴장되기도 했습니다. 여러 교수님들과 다른 학생분들이 친절하게 대해 주셔서 별 트러블 없이 잘 마무리 되었고 여러 분야를 하는 사람들을 만나면서 다양한 방면으로 지식을 넓힐 수 있는 계기가 되었습니다. 이렇게 결과물로 나오니 뿌듯하고 도와주신 랩 사람들에게 고맙습니다.

6.   기타

같이 이 프로젝트에 참여한 병수 형, 가영, 보람 박사님, 유진 모두 감사드립니다. 또한 연구에 같이 참여하신 서울대, 성균관대, GIST 학생 분들과 이원재 교수님, 권재영 교수님, 김영준 교수님께 감사드립니다. 마지막으로 이런 프로젝트에 처음 참여하고 논문을 써서 아무것도 모르는 저를 이끌어 주셔서 좋은 논문을 쓰게 해 주신 서성배 교수님께 감사드립니다.


  1. Afia Tasnim Rahman (바이오나노의약 실험실, 전상용 교수님)

    질문 염증성 장 질환을 효과적으로 치료할 수 있는 경구용 약물 개발 필요 체내 유래 항산화 물질인 빌리루빈의 장내 흡수가 용이한 물질로의 개발 가능성 발견 활성 산소종에 대한 제거 효과가 탁월하다고 알려진 빌리루빈과 점막 부착성과 생적합성을 동시...
    Date2024.02.26 By생명과학과 Views57
    Read More
  2. 김수현 (동물세포공학 연구실, 이균민 교수님)

    질문: CHO 세포의 모든 유전자를 확인하여 항체의약품 생산성 향상을 위한 유전자를 찾을 수 있을까? 발견: 1. ATF7IP 및 SETDB1 유전자 발견 (후성유전 조절 관련) 2. Knock-out validation 결과 → 이중항체 생산성 2.7-fold 향상 → 단일항체 생산...
    Date2024.02.22 By생명과학과 Views64
    Read More
  3. 구보민 (분자종양유전학 연구실, 임대식 교수님)

    질문 췌장암 발병 시 PRMT1의 역할과 그 기전이 무엇일까? PRMT1이 새로운 췌장암 환자 치료제 타깃이 될 수 있을까? 발견 췌장암 환자 및 마우스 모델에서 PRMT1이 나쁜 예후 인자(poor prognostic factor)로 작용한다. PRMT1은 췌장암 세포에서 염색질 접근...
    Date2024.02.26 By생명과학과 Views87
    Read More
  4. No Image

    박지연 (분자세포 면역학 연구실, 강석조 교수님)

    질문 호염구(basophil)는 말단 발달 과정에서 어떻게 그 고유 기능을 획득하도록 최종 발달을 완료하였을까? 발견 호염구는 알레르기와 같이 제2형 면역 반응으로 매개되는 질환의 주된 작용 세포로, IgE 수용체를 통해 활성화되면 degranulation과 사이토카...
    Date2024.02.26 By생명과학과 Views116
    Read More
  5. 전이선, 정다운 (감각 통합 신경 시스템 연구실, 이승희 교수님)

    Question. 청소년기의 사회적 고립이 뇌 활성과 행동 기능에 어떤 영향을 미칠까? 성별에 따른 효과와 뇌 영역 및 메커니즘 탐구 Findings. 청소년의 사회적 고립에 의한 세 가지 표현형의 변화가 암컷 쥐에서만 발견 1)과민한 사회성 2)왼쪽 안와전두피질(Or...
    Date2024.02.26 By생명과학과 Views198
    Read More
  6. 변유경, 김남식, 김규리 (신경교세포 연구실, 정원석 교수님)

    질문 별아교세포의 포식 작용을 조절하는 요소는 무엇인가? 아동기 스트레스가 정신 질환을 일으키는 메커니즘은 무엇인가? 발견 영유아 시기에 스트레스 상황을 겪게 되면 성인으로 성장하는 과정 동안 뇌 신경 회로망 및 기능이 크게 변화되어 조현병 및 우...
    Date2024.02.26 By생명과학과 Views209
    Read More
  7. 강문영 (생태학 연구실, 김상규 교수님)

    Question • 담배꽃이 만들어내는 향기물질인 benzylacetone(BA)은 어떤 유전자들에 의해 만들어지는 걸까? Results • ScRNAseq 을 통해 cell cluster 를 분류한 뒤, epidermal cell 에서 BA 전구체인 Phenylalanine 합성 유전자들의 발현이 높음 확...
    Date2024.02.27 By생명과학과 Views231
    Read More
  8. 손경표 (분자세포 면역학 연구실, 강석조 교수님)

    질문 STING의 활성산소에 의한 비활성형 다량체의 응집을 조절하는 기전이 존재하는가? 발견 STING은 선천면역 경로의 필수적인 어댑터 단백질로서 세포내 이동, 번역 후 변형, 다량체 형성 등을 통해서 활성이 조절된다고 알려지었으나 과도한 활성산소에 의...
    Date2024.02.26 By생명과학과 Views356
    Read More
  9. 이진형, 김보람, 김병수, 황가영, 이유진 (신경내부인지 연구실, 서성배 교수님)

    1. 배경지식 초파리에서 GAL4-UAS system은 특정 부위에 특정 유전자를 발현시킬 수 있게 해 줍니다. GAL4는 yeast transcription activator protein이고 UAS는 GAL4가 특정적으로 붙는 enhancer인데 GAL4가 있으면 UAS를 enhancer로 가지는 유전자의 전사가 ...
    Date2020.12.29 By생명과학과 Views1356
    Read More
  10. 오양균 (NYU) (신경내부인지 연구실, 서성배 교수님)

    배경지식 동물들은 미각 이외에도 체내에 영양분을 인지할 수 있는 신경세포들을 가지고 있습니다. 이러한 영양분 인지 신경세포들은 대략 60 년 전에 전기생리학자들에 의해서 처음으로 발견되었습니다. 꽤 오래전에 발견 되었음에도 이들 신경세포들의 생물...
    Date2021.01.06 By생명과학과 Views1584
    Read More
  11. 김재현(감각처리 연구실, 이승희 교수님)

    배경 지식 인간을 포함한 모든 동물은 외부 환경에서 유입되는 다양한 감각 정보를 지각하여 상황에 맞는 행동을 수행합니다. 한 예로, 교통 신호등 앞에서 운전자가 붉은색 신호를 볼 경우 출발하지 않고 기다려야 하며, 푸른색 신호로 바뀔 경우 출발할 수 ...
    Date2021.08.24 By생명과학과 Views1684
    Read More
  12. 김진은 (신경내부인지 연구실, 서성배 교수님)

    Date2021.01.07 By생명과학과 Views1987
    Read More
  13. 박기현 (진핵세포전사 연구실, 김재훈 교수님)

    배경 지식 RNA 전사에 관련된 연구는 그동안 RNA polymerase가 주로 이동하는 방향이자 protein-coding 유전자 발현에 해당하는 sense 전사에 집중되어 있었습니다. 하지만 시퀀싱 기술의 발달로, 게놈의 상당 부분에서 반대 방향의 전사, 즉 antisense 전사...
    Date2022.05.02 By생명과학과 Views2046
    Read More
  14. 송유향, 황양선 (감각처리연구실, 이승희 교수님)

     <소마토스타틴 (SST)의 작용 메커니즘을 나타낸 모식도 (좌)와 소마토스타틴 처리에 의한 시각 인지 능력 향상 효과(우)> 1. 배경지식 소마토스타틴은 시상 하부에서 뇌하수체 성장 호르몬의 분비를 억제하는 신경펩타이드로 처음 알려졌습니다. 이후 소마...
    Date2020.04.30 By생명과학과 Views2121
    Read More
  15. 이준혁(신경교세포 연구실, 정원석 교수님)

    배경지식과 질문 성인 뇌는 기억형성이나 무언가를 인지할 때 시냅스를 만들고 없애는 과정을 끊임없이 반복합니다. 하지만 여전히 어떠한 기전에 의해서 시냅스가 없어지는지, 그리고 굳이 시냅스를 왜 제거하고 있는지는 잘 알려진 바가 없었습니다. 뇌의 ...
    Date2021.08.17 By생명과학과 Views2394
    Read More
  16. 서예지 (바이오이미징&광유전학 연구실, 허원도 교수님)

    <그림. 1> Graphical Abstract: 광유도 TrkB 수용체의 국소활성화를 통한 신경세포의 극성화 <그림. 2> 광유도 TrkB 수용체의 국소활성화에 의한 액틴파 형성 및 축삭 단백질의 축적 1. 배경지식 신경세포는 발달과정동안 여러 개의 미성숙 신경 돌기를 가지...
    Date2019.12.26 By생명과학과 Views2434
    Read More
  17. 유다슬이 (바이오이미징 & 광유전학 연구실, 허원도 교수님)

    <그림 1> 항체조각과 Optobody 모식도 <그림 2> 광활성화된 항체에 의한 항원의 비활성 및 기능 억제 1. 배경지식 항체는 면역반응의 핵심 물질이며 질병 치료제로도 사용 중에 있습니다. 항체를 직접적인 질병 치료제로 사용하는 경우 항체 단백질을 정제하...
    Date2019.12.26 By생명과학과 Views2503
    Read More
  18. 김경덕 (시냅스 뇌질환 연구실, 김은준 교수님)

     <전시냅스 단백질PTPσ에 의한 NMDA 수용체 안정성 조절 > 1. 배경지식 시냅스는 3,000 개 이상 종류의 단백질이 적절한 위치에 적절한 양 만큼 위치해야 제대로 기능할 수 있는 대단히 복잡한 구조체입니다. 시냅스가 형성되기 위해서는 두 뉴런의 신경 ...
    Date2020.03.18 By생명과학과 Views2505
    Read More
  19. 신왕용 (시냅스뇌질환 연구실, 김은준 교수님)

    <Grin2b 점돌연변이 생쥐의 비정상적 전기생리학적 특징과 특정시기의 NMDAR 활성을 통한 이상 회복> 1. 배경지식 소단위 단백질 GluN2B를 포함하고 있는 NMDA 수용체는 시냅스 장기 약화 (Long-term depression) 등 시냅스 가소성에 중요한 역할을 한다고 알...
    Date2020.05.29 By생명과학과 Views2505
    Read More
  20. 김종원 (생체분자공학 연구실, 김학성 교수님)

    ▷인터뷰 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요. 현재 민감도와 특이성이 높은 표적 물질의 검출 및 분석법이 다양하게 개발되고 있습니다. 대개는 신호 발생 물질인 효소를 나노입자나 항체에 화학적 결합을 통해 이용하고 있으나, 화학적 결합 방법은 불안정...
    Date2017.12.26 By생명과학과 Views2571
    Read More
Board Pagination Prev 1 2 3 4 5 6 Next
/ 6