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생명과학의 역사를 쓰는 사람들 Research Highlights

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인터뷰 변현종
논문 Hyunjong Byun, Jiyeon Park, Sun Chang Kim, and Jung Hoon Ahn (2017) A lower isoelectric point increases signal sequence−mediated secretion of recombinant proteins through a bacterial ABC transporter. J. Biol. Chem. Vol. 292, 19782-19791
한줄요약 ABC 수송체의 단백질 수송 효율이 수송되는 단백질의 pI와 연관이 있다


인터뷰


 1. 논문 내용과 의미를 설명해 주세요.

   타입 I 분비 시스템(T1SS)  “폴리펩타이드를 수송하는 ABC 수송체들의 단백질 분비 특성에 관해 연구한 논문입니다. 우리는 Pseudomonas fluorescens 박테리아가 보유한 ABC 수송체인 “TliDEF를 모델 시스템으로 하였으며, 이번 연구를 통해 폴리펩타이드를 수송하는 ABC 수송체들은 해당 수송체가 분비하는 단백질(화물 단백질)pI가 낮을수록 분비효율이 증대된다는 사실을 검증했습니다. 특히 이번 연구는 유전자 재조합 기술을 통해 신호 서열 (Signal sequence)”를 붙여준 외래(박테리아가 원래 가지고 있지 않은) 화물 단백질들에서 이러한 특징이 관찰된다는 점을 밝혀내어, 수송되는 단백질의 pIABC 수송체들의 분비 효율에 있어 아주 중요한 팩터라는 것을 밝혀냈습니다. 또한 폴리펩타이드를 수송하는 ABC 수송체들이 채널 통로 안쪽에 진화적으로 매우 보존된 양전하를 띤 아미노산 서열들을 가진다는 사실을 밝혀내어 이 현상의 원인을 설명할 수 있는 모델을 제시하기도 했습니다.


2. 연구과정에서 있었던 에피소드를 소개해 주세요.

   처음으로 쓴 논문이라 그런지 논문을 작성하는 과정에서 여기저기 좌충우돌하는 일이 많았습니다. 특히 겨우겨우 제출한 다음 Reviewer에게서 답장이 왔을 때는(지도교수님께서는 그 정도면 꽤 우호적인 답장이라 하셨지만) 어떻게 답해야 할지 몰라서 끙끙 앓았던 기억이 납니다. 결국은 Reviewer가 요구한 실험을 여러 개 추가하고 그 중에 가장 스케일이 컸던 추가 실험 요구는 중요한 실험이지만 스케일이 너무 커서 별도의 연구 프로젝트로 분리하는 것이 좋을 것 같다.”라는 답변을 보내 결국 리뷰어에게 OK를 받았던 기억이 납니다.


3. 연구를 통해 얻은 지혜를 후배들에게 들려주세요.

   “실험은 안 될 때도 있고, 안 될 때가 사실 더 많다. 그러나 좌절하지 말고 계속해서 나아가 결과를 쌓아가다 보면 그것이 왜 안 되었는지 이유가 보일 수 있고, 그러면 그것이 또 논문의 소재가 된다.”가 제가 이번 연구를 통해 얻은 교훈입니다.


4. 나는 왜 명과학자가 되었는가?

   아직 분야에 개척되지 못한 부분이 너무나 많습니다. 특히 이제 생명과학은 컴퓨터와 인공지능의 발전으로 새로 개척될 분야가 아주 넓은 것 같습니다. 또 적성에 맞는 것 같기도 하고요.


5. 다른 하고 싶은 이야기

   이제 막 첫 논문을 내고 나니 과학자로서 첫 발을 딛은 것 같아 뿌듯합니다. 빨리 졸업하고 학위를 따서 연구실에 정식으로 연구원으로 들어가 일하고 싶습니다.

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    Date2024.02.22 By생명과학과 Views17
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  2. 주재건 (후성유전체 및 계산생물학 연구실, 정인경 교수님)

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    Date2024.02.26 By생명과학과 Views18
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    이정운 (후성유전체 및 계산생물학 연구실, 정인경 교수님)

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    Date2024.02.26 By생명과학과 Views18
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  4. 박준우 박사(신경발달 및 재생 연구실, 김진우 교수님)

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    Date2024.02.22 By생명과학과 Views26
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  5. 임소연 (신경발달 및 재생 연구실, 김진우 교수님)

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    Date2024.02.22 By생명과학과 Views26
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    Date2024.02.22 By생명과학과 Views27
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  7. 조혜연 (기억생물학 연구실, 한진희 교수님)

    살아있는 생쥐 뇌에서 기억저장 뉴런(신경 세포)을 표지하고 추적, 관찰할 수 있는 기술을 이용해 같은 경험을 다시 할 때, 원래 존재하던 오래된 기억 뉴런이 새로운 뉴런으로 교체됨을 규명.
    Date2024.02.23 By생명과학과 Views27
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  8. 정이레 (기억생물학 연구실, 한진희 교수)

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    Date2024.02.23 By생명과학과 Views28
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    Date2024.02.22 By생명과학과 Views32
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  10. 김규광 (기능유전체 및 계산생물학 연구실, 정인경 교수님)

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    Date2024.02.26 By생명과학과 Views32
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  11. 이한솔 (기억생물학 연구실, 한진희 교수님)

    기억 리콜 때 CA1 뉴런의 활성을 측정한 결과, 학습에 의해 활성이 증가하는 세포 앙상블이 있음을 확인함. 또한 이 활성 증가가 기억 리콜 때 측정한 freezing (공포 기억 리콜 인덱스) 수준과 유의미한 상관관계가 있음을 규명.
    Date2024.02.23 By생명과학과 Views33
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  12. 김찬희, 권용민 (식물학 연구실, 최길주 교수님)

    질문 식물 광수용체인 파이토크롬은 포토바디라고 불리는 액체-액체 상 분리 응집체를 형성한다. 파이토크롬 포토바디는 어떤 단백질들로 구성되어 있을까? 발견 식물 광수용체인 파이토크롬은 포토바디라는 빛에 조절되는 액체-액체 상 분리 응집체를 형성한...
    Date2024.02.22 By생명과학과 Views34
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  13. 김효상 (시냅스 뇌질환 연구단, 김은준 교수님)

    질문 염색질 재조합 단백질의 결손에 따른 자폐 스펙트럼 유사 행동은 어떻게 치료될 수 있을까 발견 본 연구에서는 ARID1B 유전자의 돌연변이가, 생쥐 모델에서 어떻게 사회성 저하와 반복 행동을 유발하는지, 시냅스와 RNA의 분석을 통해서 밝혀내었고, 유...
    Date2024.02.26 By생명과학과 Views35
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  14. 김재호 박사 (생체방어 연구실, 이흥규 교수님)

    질문 고 포도당 음료 보충을 통해 뇌종양의 성장이 억제되는가? 억제 되면 기전은 무엇인가? 발견 • 교모세포종 실험 쥐 모델에서 고 포도당 음료 보충을 통해 뇌종양의 성장이 억제되는 현상을 관측했고 이에 더해 이러한 억제 효과가 장내 미생물의 특...
    Date2024.02.22 By생명과학과 Views36
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  15. 문진우 (암 에피제네틱 연구실, 김미영 교수님)

    질문 악성 췌장암의 진행 및 전이를 유발하는 유전자와 그 기작은 무엇인가? 발견 기저형 (basal-like)의 아형을 보이는 췌장선암 (pancreatic ductal adenocarcinoma, PDAC)은 보다 공격적인 특성을 보이며, 빠른 진행과 전이 양상을 보입니다. 본 연구에서...
    Date2024.02.23 By생명과학과 Views36
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  16. 황현정, 박태림, 김형인(김윤기, 조원기 교수님 연구실 공동연구)

    질문 - YTHDF2가 비정상 단백질 처리 경로에 어떤 영향을 미칠까? - YTHDF2와 상호작용하는 단백질은 무엇일까? 발견 정상적인 생명 활동 유지에 중요한 단백질 형성과정은 정상적인 단백질 뿐만 아니라 비정상적인 단백질이 그 과정 중 형성되기도 한다. 비...
    Date2024.02.22 By생명과학과 Views43
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  17. 장지윤, 신민경, 박주리 (RNA 유전체학 연구실, 김윤기 교수님)

    질문 -원형 RNA에서 일어나는 새로운 단백질 합성기전은 무엇일까? - RNA 백신 개발에 응용 될 수 있을까? 발견 생물학적 기능을 나타내는 중요 원리인 central dogma는 DNA로부터 시작해 RNA, 단백질로 이어진다. 이때 최종 생산 물질인 단백질은 번역 과정...
    Date2024.02.22 By생명과학과 Views46
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  18. 유도현 (바이오나노의약 실험실, 전상용 교수님)

    질문 염증성 장 질환을 효과적으로 표적할 수 있는 약물 전달 플랫폼 개발 필요 염증 조직 특이적인 당 결합 단백질 발현 양상을 활용한 표적 치료 전략 개발 가능성 발견 장내 균의 당질층은 장 표면의 당질층 혹은 당 결합 단백질과 결합함. 염증성 장 질환...
    Date2024.02.26 By생명과학과 Views47
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  19. 김은아, 함석진 (RNAging Lab, 이승재 교수님 연구실)

    질문 미토콘드리아 Krebs cycle 부산물이 개체 수준의 면역에 어떤 영향을 미칠까? 발견 미토콘드리아의 Krebs cycle 효소 중 하나인 ACO-2의 knockdown이 예쁜꼬마선충에서 UPRmt을 활성화 하여 개체수준에서 선천적 면역을 강화 시킴을 발견함. ACO-2의 억...
    Date2024.02.22 By생명과학과 Views50
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  20. 신호철, 김유진 (바이오나노의약 실험실, 전상용 교수님)

    질문 여러 종의 암의 공통적 특징을 표적하는 범용 치료용 항암 백신 개발 필요 암 연관 섬유아세포를 표적 제거하는 백신 전략의 암 치료 효용성 발견 종양미세환경에서 가장 많은 부분을 차지하는 암 연관 섬유아세포는 암 성장 촉진 인자 및 세포외기질을 ...
    Date2024.02.26 By생명과학과 Views50
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